食品净化工程做好对各类加工设备的分门别类的保养，学习设备在功能、材料选择、设备验证方面的各种知识。要保证食品设备不被二次污染，处理的途径有：

生产中产生粉尘的设备应设置除尘机或捕尘机构，如粉碎机、压片机等；

在工艺上，使用气体的设备是气体与食品或直接与食品包装材料接触的设备，气体需要经终端过滤除菌处理；

洗瓶或其他食包材清洗设备，应考虑到工艺用水的洁净度，般使用已消毒自来水或纯化水，如洗瓶机、胶塞清洗等设备的用水

在洁净室或安装食品动态消毒机的受控场所净化工程通过净化空调或通风系统对各功能间净化并保持相对的压差，可防止粉尘扩散，防止交叉污染。